El Congreso tiene como finalidad poner al día las investigaciones y estudios sobre la situación de las sociedades islámicas y cristianas en la Península Ibérica en el siglo XIII, y sobre todo en Sarq al-Ándalus, y interactuación entre ambas sociedades. También pretende analizar las transformaciones producidas por la transferencia del poder de las sociedades comunitarias islámicas a la jerárquica y feudal cristiana, así como los efectos de la repoblación, la formación de nuevos grupos de poder y su repercusión e impacto sobre el territorio.
Profundizar en las nuevas perspectivas de estas sociedades de transición, justificación del discurso ideológico, la proyección de los nuevos poderes y los mecanismos de control territorial a través de los registros materiales y diplomáticos, tratando de aplicar estrategias de investigación interdisciplinar (arqueología, geografía, antropología, sociología, ciencia y técnica, arquitectura, historia del arte, filosofía, literatura, arabismo, teología, etc.).
El Congreso pretende crear un espacio de clarificación y debate en torno a los decisivos cambios que se producen a partir de segundo tercio del siglo XIII, al llevarse a cabo la conquista y ocupación cristiana de las poblaciones islámicas del norte del Reino de Murcia, estableciéndose la decisiva frontera entre el reino catalano – aragonés y el castellano en el Sureste Peninsular.